Kako bi dodatno poboljšali svoje poslovanje u organizacijskom i tehnološkom smislu, poduzeće je pokrenuo proces certificiranja sustava kvalitete prema standardu EN ISO 9001:2000 u studenom 2007. godine. U idućem razdoblju poduzeće je prilagodilo sustav upravljanja normi te je 2020. godine uspješno proveden certifikacijski audit prema normi EN ISO 9001:2015.

Poduzeće Magma d.o.o.  je certificirano za sustav upravljanja prema EN ISO 14001:2015 za djelatnosti proizvodnje metalnih konstrukcija, posuda pod tlakom i energetskih postrojenja. Dodatno, poduzeće Magma d.o.o. posjeduje i Certifikat o sposobnosti za izvođenje zavarivačkih radova prema HRN EN ISO 3834-2 na području izrade posuda pod tlakom, zavarenih sklopova i čeličnih konstrukcija.

Poduzeće je također certificirano prema prema direktivi PED 2014/68/EU. Osim navedenog, Magma d.o.o. posjeduje i Certifikat za izradu i montažu dinamički opterećenih čeličnih konstrukcija do EXC4 prema EN 1090-2 te Certifikat za zavarivanje željezničkih vozila i sastavnih dijelova prema EN 15085-2.